С первых дней Великой Отечественной войны дивизия защищала юго-западные границы СССР. Особенно отличилась при обороне города Киева. Приказом от 27 декабря 1941 года дивизия была расформирована, хотя фактически из-за больших потерь она перестала существовать раньше. Вновь воинское подразделение было сформировано в городе Котласе и Котласском районе в период с 15 декабря 1941 по 10 января 1942 года как 414-я стрелковая дивизия. В феврале 1942 года она была переименована в 28-ю стрелковую дивизию. Командиром дивизии был назначен полковник Г. И. Шерстнев, начальником штаба - подполковник А. В. Якушев. Штаб дивизии располагался на улице Калинина в деревянном двухэтажном доме - бывшем Доме колхозника, сейчас на этом месте находится здание Отдела статистики. В дивизии сражались с врагом воины из Коми республики, Архангельской и Вологодской областей, в том числе более 2 тысяч котлашан - из города и района. В составе дивизии было много бывших заключённых, отбывающих наказание в местных лагерях и колониях, и подавших просьбу о направлении на фронт. Дивизия была многонациональной: более одной трети воинов дивизии составляли коми, остальные - русские и представители 37 других национальностей страны. К месту формирования, на укомплектование частей, прибыло более 12 тысяч человек. 12 марта 1942 года личный состав дивизии принял военную присягу. Комиссия Архангельского военного округа после всесторонней инспекторской проверки признала соединение вполне боеспособным и готовым к отправке на фронт. Действовала дивизия в 90-м и 100-м стрелковых корпусах в составе 3-й и 4-й ударных и 22-й армий Калининского и 2-го Прибалтийского фронтов. С 9 апреля 1942 года начала переброску в район Андреаполя и заняла позиции во втором эшелоне. В конце июля вышла на передовую на рубеж Ступино - Курьяково - Поречье. 23 августа 1942 года приняла свое боевое крещение, вступила в бой на подступах к городу Великие Луки. Принимала участие в Великолукской наступательной операции, Невельско-Городокской операции, Мадонской наступательной операции, Рижской операции, освобождении городов Великие Луки, Невель, Полоцк, Крустпилс, Себеж, Даугавпилс, Рига, Елгава, взятии Тильзита. 16 апреля 1945 года была переброшена под Бухарест, где и закончила войну. За освобождение от фашистов Великолукского района Псковской области дивизия в январе 1943 года получила благодарность Верховного Главнокомандования. 7 октября 1943 года за освобождение города Невеля 28-я стрелковая дивизия получила почетное наименование Невельской и благодарность от Верховного Главнокомандующего. За успешные боевые действия при отражении вражеских атак около деревни Сомино Невельского района Псковской области и проявленные при этом мужество, отвагу, героизм и стойкость военный совет 3-й ударной армии 10 декабря 1943 года объявил благодарность воинам 28-й Невельской дивизии. 4 июля 1944 года за освобождение города Полоцка Белорусской ССР дивизия получила 3-ю благодарность от Верховного Главнокомандования. За освобождение территории Латвийской ССР, за образцовое выполнение заданий командования и проявленные при этом доблесть и мужество Указом Президиума Верховного Совета СССР от 9 августа 1944 года дивизия была награждена орденом Красного Знамени. Четвертая благодарность личному составу дивизии была объявлена за отличные боевые действия в боях за город Двинск (Даугавпилс). Соединение встретило День Победы 9 мая 1945 года в городе Бухаресте (Румыния). Но многие однополчане не дожили до этого светлого дня. В 1942 году во время боевого крещения погиб котлашанин командир роты 144-го стрелкового полка Н. В. Боголюбов. В начале 1943 года во время Ступино-Пореченской операции погибли котлашане: командир взвода лейтенант Н. Н. Сабинин и начальник химслужбы капитан Д. С. Павлов. В ночь на 23 декабря 1944 года при выполнении боевого задания пал смертью храбрых командир отделения 67-го отдельного саперного батальона Герой Советского Союза Александр Васильевич Пелевин (открыть отдельно). В городе Котласе в 1984 году, в память о подвиге бойцов дивизии, улица Восточная была переименована в улицу 28-й Невельской дивизии и в 1994 году установлена мемориальная доска (открыть отдельно). В 1975 году на Ступинской высоте под городом Великие Луки Псковской области была установлена мемориальная доска в память о воинах 28-й Невельской Краснознаменной стрелковой дивизии, проявивших мужество и отвагу при овладении Ступинско-Пореченским узлом в декабре 1942 года. 16 февраля 1989 года Сыктывкарский горисполком переименовал одну из улиц в Сыктывкаре на улицу 28-ой Невельской дивизии. 19 февраля 2013 года в Сыктывкаре открыта мемориальная доска в честь героев 28-ой Невельской Краснознаменной стрелковой дивизии.