Последние годы он тяжело болел. Перенес микроинсульт, операцию по пересадке почек. Невзгоды последних лет Филатов переносил мужественно. Никогда не прекращал работать. Даже в больничной палате писал стихи и до последнего времени вeл программу "Чтобы помнили". Коллеги и друзья говорят, что Филатов был чрезвычайно светлым, добрым и очень талантливым человеком.

Не найдя в "Конармии" описания легендарных сражений, героических подвигов буденновцев, прославленный командарм упрекал автора в мещанско-обывательской точке зрения, обвинял его в написании карикатуры. На следующий день был опубликован ответ Горького, который поддержал Бабеля: "Такого красочного и живого изображения единичных бойцов, которое давало бы мне ясное представление о психике всего коллектива, всей массы Конармии и помогло бы мне понять силу, которая позволила ей совершить исторический, изумительный ее поход, - я не знаю в русской литературе". Позднее в спор включился еще один бывший участник Конармии - писатель Всеволод Вишневский, пославший Горькому свою пьесу "Первая Конная": "Не то, не то дал Бабель! Многого не увидел. Дал лишь кусочек: Конармия, измученная в боях на польском фронте. Да и то не всю ее, а осколки". Ответ Горького был прост: "Такие вещи, как ваша "Первая Конная" и "Конармия", нельзя критиковать с высоты коня".